苜蓿乙烯应答因子基因的表达特性和生物信息学分析

编号 zgly0001624880

文献类型 期刊论文

文献题名 苜蓿乙烯应答因子基因的表达特性和生物信息学分析

作者 陈婷婷  杨青川  张新全  康俊梅  丁旺  张铁军 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所  四川农业大学草业科学系 

母体文献 草业学报 

年卷期 2012年06期

年份 2012 

分类号 S541.9 

关键词 紫花苜蓿  乙烯应答因子  生物信息学分析  半定量RT-PCR  表达分析 

文摘内容 乙烯应答因子(ethylene response factor,ERF)是植物特有的一类转录因子,参与植物生长发育和胁迫应答等多个生理生化过程。本研究以拟南芥AP2结构域为探针搜索美国国立生物技术信息中心(NCBI)的苜蓿属蛋白质数据库,运用生物信息学软件分析苜蓿乙烯应答因子的系统进化、疏水轮廓、二级结构、信号肽以及亚细胞定位情况。运用半定量RT-PCR技术研究5个紫花苜蓿乙烯应答因子基因(MsERF1,MsERF2,MsERF6,MsERF7,MsERF9)表达的组织差异性以及多种处理条件下的表达特性。结果表明,5个乙烯应答因子基因在叶中的表达量都明显高于其他组织,不同基因有不同的组织表达特性;NaCl和PEG6000对MsERF2的表达没有影响,但Al2(SO4)3能诱导其表达,其余基因的表达都受这3种处理的诱导;脱落酸对MsERF2的表达没有影响,能够诱导其他基因的表达;生长素只能诱导MsERF6的表达,对其他基因的表达没有影响;赤霉素、茉莉酸甲酯和乙烯利对5个基因的表达都起促进作用。本研究为进一步研究苜蓿乙烯应答因子的结构和功能奠定了基础,同时为研究不同信号传导途径之间的相互作用提供了依据。