芒果GGPPS基因的克隆与表达分析

编号 zgly0001566192

文献类型 期刊论文

文献题名 芒果GGPPS基因的克隆与表达分析

作者 吕勇志  陈业渊  王鹏 

作者单位 海南大学农学院  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S667.7  Q943.2 

关键词 芒果  GGPPS  基因克隆  后熟  表达分析 

文摘内容 在植物中,异戊烯焦磷酸（GGPP）是赤霉素、胡萝卜素、叶绿素等异戊二烯类化合物的公共前体物质。从芒果栽培品种贵妃芒的新鲜叶片中提取DNA和RNA,根据转录组测序拼接结果设计引物扩增得到香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因（Min GGPPS1）。通过测序、多重比对和聚类分析,证实该片段属于GGPPS的全长基因并且为最大的ORF,全长为1 100 bp。与芒果Min GPS2（AFJ52722.1）氨基酸序列同源性为92%。蛋白质序列分析表明该序列含有两个DDx2-4D保守基元（FARM和SARM）基元和一个Cxxx C基元。我们选取了拟南芥中12个GGPPS基因、2个FPPS基因、2个SPPS基因、一个GPS基因及其他物种的相关基因,通过聚类分析表明,Min GGPPS1属于香叶基香叶基焦磷酸合成酶大亚基。表达分析表明:Min GGPPS1在叶片中表达量最高,茎部表达量最低,青果果皮和成熟果果皮中表达量相似,在成熟果肉中的表达量大约是青果果肉表达量的5倍,暗示Min GGPPS1具有调控果肉后熟的功能。