橙黄乳菇遗传多样性分析

编号 zgly0001433482

文献类型 期刊论文

文献题名 橙黄乳菇遗传多样性分析

作者 李河  徐建平  郭亮  刘君昂  周国英  朱丹雪 

作者单位 经济林培育与保护教育部重点实验室  中南林业科技大学  中南林业科技大学林学院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S646 

关键词 橙黄乳菇  地理种群  遗传多样性  遗传分化  ITS-5.8S序列 

文摘内容 分析来自湖南省道县(DX)、张家界市(ZJJ)、芷江县(ZJ)、麻阳县(MY)和贵州省玉屏县(YP)以及泰国(TL)6个橙黄乳菇种群38个菌株的ITS-5.8S序列的遗传结构和遗传多样性。所有的ITS-5.8SrDNA序列样品共检测到2个变异位点,碱基A、T、G、C的平均含量分别为22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根据序列的核苷酸变异共定义了3种单倍型,其中单倍型Hapolotype 3是湖南和贵州5个种群共享单倍型,Hapolotype 2为6个种群的共享单倍型。中国橙黄乳菇各地区种群的单倍型多样性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之间,表明橙黄乳菇种群具有较高的单倍型多样性。遗传分化指数(fixation index,FST)表明,不同地理种群间的遗传分化较大。AMOVA分析显示,种群间的遗传变异占总变异的17%,种群内部变异占总变异的83%。Mantel测试显示地理距离与种群的遗传分化FST值之间线性关系显著(P<0.05)。采用N-J法构建的分子系统树表明,当与乳菇属相近种进行比较时,湖南、贵州和泰国不同地区的所有橙黄乳菇样品紧密聚为一支。采用中性检验进行分析,推测湖南橙黄乳菇群体样品在进化上遵循中性模型,并且经历过种群扩张过程。研究结果表明橙黄乳菇种群具有丰富的遗传多样性。