基于Meta分析的猪后腿性状QTL整合定位

编号 zgly0000807449

文献类型 期刊论文

文献题名 基于Meta分析的猪后腿性状QTL整合定位

作者 刘璐  苏玉虹  王军  赵会仁  袁志发 

作者单位 辽宁医学院  辽宁医学院畜牧兽医学院  西北农林科技大学理学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(4)

页码 31-37

年份 2012 

分类号 S114 S813.3 

关键词 猪  后腿性状  QTL  Meta分析 

文摘内容 【目的】:通过Meta分析,利用数学模型整合与优化猪后腿腿臀质量、腿臀肉质量和腿臀比性状的QTL,提高QTL定位的准确度和有效性,为猪后腿性状QTL的精细定位和分子辅助育种奠定基础。【方法】:收集猪后腿腿臀质量,腿臀肉质量和腿臀比性状的QTL及其相关信息,利用BioMercator2.1,将原始QTL映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建新的整合图谱,分析得到QTL簇。进一步对各QTL簇进行Meta分析,定位＂真实＂QTL(MQTL),缩短95%置信区间,减少定位误差。【结果】:收集了93个猪后腿性状的QTL及其相关信息,经比对、映射,构建了新的整合图谱,发现19个QTL簇。通过Meta分析,得到19个MQTL,其图距比原平均图距缩短16.19%～78.96%,其中,MQTL1、MQTL5、MQTL6、MQTL8、MQTL9、MQTL10、MQTL11、MQTL12和MQTL17等9个MQTL图距的缩短比例均超过50%。【结论】:Meta分析得到的MQTL图距均有不同程度缩短,最小的仅1.75cM,缩短比例最大可达78.96%,提高了QTL定位的准确度和有效性。