基于Meta分析的猪肌内脂肪QTL整合定位

编号 zgly0000807401

文献类型 期刊论文

文献题名 基于Meta分析的猪肌内脂肪QTL整合定位

作者 刘璐  苏玉虹  王军  赵会仁  袁志发 

作者单位 辽宁医学院  辽宁医学院畜牧兽医学院  西北农林科技大学理学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(5)

页码 24-30

年份 2012 

分类号 S114 S813.3 

关键词 猪  肌内脂肪  QTL  Meta分析 

文摘内容 【目的】:通过Meta分析,用数学模型分析与优化定位分散的猪肌内脂肪QTL,提高QTL定位的准确度和有效性,为猪肌内脂肪相关基因的精细定位和基因挖掘奠定基础。【方法】:收集猪肌内脂肪QTL及其相关信息,以美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱为参考图谱,利用BioMercator2.1将各QTL映射到参考图谱上,构建新的整合图谱,得到QTL簇。对得到的QTL簇进行Meta分析,缩短置信区间,定位＂真实＂QTL(MQTL),减少QTL的定位误差。【结果】:收集了67个猪肌内脂肪QTL及相关信息,经比对、映射,构建新的整合图谱,发现了12个QTL簇。通过Meta分析,得到12个MQTL(MQTL1～MQTL12),其图距比原平均图距缩小29.16%～87.40%,其中,MQTL3、MQTL5、MQTL6、MQTL7、MQTL9、MQTL12图距较原平均图距缩小比例均超过50%,其图距分别为7.76,6.72,5.20,19.45,15.61,9.37cM。【结论】:得到了12个猪IMF的MQTL,其图距比原平均图距均有不同程度缩小,最小仅5.20cM,图距缩小比例最大可达87.40%,提高了QTL定位的准确度和有效性。