猪肉系水力相关QTL的整合定位与基因关联分析

编号 zgly0000807207

文献类型 期刊论文

文献题名 猪肉系水力相关QTL的整合定位与基因关联分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘璐  苏玉虹  王军  赵会仁  袁志发 

作者单位 辽宁医学院  辽宁医学院畜牧兽医学院  西北农林科技大学理学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(6)

页码 28-34

年份 2012 

分类号 S114 S828.2 

关键词 猪  系水力  QTL  Meta分析 

文摘内容 【目的】:通过构建整合图谱及Meta分析,利用数学模型整合优化猪肉系水力相关数量性状位点(QTL),并比较已知候选基因与＂真实＂QTL(MQTL)的位置,分析其相关性,为猪肉系数力的分子标记辅助选择奠定基础。【方法】:收集2000年至今发表的猪肉系水力相关QTL信息,以美国肉畜研究中心(USDA-MARC 2.0)公布的猪遗传连锁图谱为参考图谱,利用BioMercater 2.1软件将已报道的猪肉系水力相关QTL映射到参考图谱,构建新的整合图谱,分析其中存在的QTL簇;对各QTL簇进行Meta分析,将原始QTL整合为＂真实＂QTL(MQTL);将已知的候选基因促红细胞生成素受体基因(EPOR)、锚定蛋白1基因(ANK1)、碳酸酐酶Ⅲ基因(CAⅢ)和氟烷基因(HAL)映射到整合图谱,比较其与MQTL的位置关系,并分析二者的关联性。【结果】:共收集到80个猪肉系水力相关QTL,将其进行比对、映射后,成功构建了新的整合图谱,并通过Meta分析定位了12个MQTL,这些MQTL的图距与原始QTL的平均图距相比均有不同程度的缩短。EPOR基因、ANK1基因分别定位在MQTL3、MQTL12的置信区间内,其中ANK1基因映射到整合图谱后与MQTL12的中心位置一致。【结论】:整合定位的12个MQTL的图距为3.66～28.98cM,较原始QTL缩短35.82%～78.81%,提高了QTL定位的准确度和有效性。