紫花苜蓿PGIP同源基因克隆与序列核苷酸多态性分析

编号 zgly0001617792

文献类型 期刊论文

文献题名 紫花苜蓿PGIP同源基因克隆与序列核苷酸多态性分析

作者 桂枝  肖婷  皮永硕  袁庆华  杨建翔  刘妍  高建明 

作者单位 天津农学院农学与资源环境学院  华南农业大学农学院  中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 

母体文献 草业科学 

年卷期 2015年10期

年份 2015 

分类号 S541.9 

关键词 紫花苜蓿  PGIP  基因组序列分离  单核苷酸多态性  荧光标记PCR单链构象多态性 

文摘内容 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)是植物重要的防卫蛋白之一,了解PGIP基因的核苷酸序列是对其进行分子遗传学与分子生物学研究的前提与基础。本研究采用同源克隆法,从16个紫花苜蓿(Medicago sativa)品种的集群DNA中克隆了7个苜蓿PGIP基因的部分基因组编码序列,分别对应于蒺藜苜蓿(M.truncatula)7个不同的PGIP基因,并命名为Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP7、Ms PGIP8、Ms PGIP9、Ms PGIP10和Ms PGIP11。其中,Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP8、Ms PGIP9和Ms PGIP11的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点间的平均距离分别为20、74、34、423和21 bp,差异较大。对Ms PGIP5、Ms PGIP6、Ms PGIP8和Ms PGIP11进行荧光标记PCR单链构象多态性(FPCR-SSCP)分析,结果表明,其等位基因数目与PCR片段长度的比值分别为20、56、22和19 bp,变化趋势与这4个基因SNP位点间的平均距离基本一致。比较而言,在发现的7个苜蓿PGIP基因中,Ms PGIP9序列高度保守,Ms PGIP5和Ms PGIP11的变异较大,而Ms PGIP6与Ms PGIP8的变异中等。