药用植物猴耳环的转录组测序分析

编号 zgly0001737028

文献类型 期刊论文

文献题名 药用植物猴耳环的转录组测序分析

作者 谭志强  黄炬峰  李福明  邓乐平  毛积鹏 

作者单位 台山市红岭种子园  华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室 

母体文献 林业与环境科学 

年卷期 2021,37(3)

页码 15-21

年份 2021 

分类号 R284.1 

关键词 猴耳环  转录组测序  萜类化合物  黄酮类化合物  SSR标记 

文摘内容 利用Illumina HiSeq 4000对猴耳环Pithecellobium clypearia的主要药用部位嫩枝和叶进行了转录组测序分析。共获得24748936个高质量的reads,拼接组装到63299个Unigenes,平均长度为1117 bp。其中26101个Unigenes在Nr、UniProt、KOG、GO和KEGG数据库获得注释信息。鉴定到了192个和黄酮类化合物生物合成相关的Unigenes,主要涉及了苯丙烷、黄酮、异黄酮、黄酮醇和花青素等化合物的生物合成通路。此外还鉴定到了136个和萜类化合物生物合成相关的Unigenes,主要参与了萜类骨架、单萜、倍半萜、二萜和四萜等化合物的生物合成通路。最后在15740个Unigenes中检测到45573个SSR标记,出现频率为33.84%。综合表明猴耳环嫩枝和叶的转录组测序结果可靠,SSR标记丰度高。