SCoT结合克隆测序鉴别湖南甜橙变异类型

编号 zgly0000663722

文献类型 期刊论文

文献题名 SCoT结合克隆测序鉴别湖南甜橙变异类型

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 蒋巧巧  龙桂友  李武文  邓子牛 

作者单位 湖南农业大学园艺园林学院  国家柑橘改良中心长沙分中心 

母体文献 中国农学通报 

年卷期 2011,27(6)

页码 148-154

年份 2011 

分类号 S6 

关键词 甜橙  SCoT  均匀设计  序列比对 

文摘内容 本试验对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异;结果表明,甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为: DNA模板80ng,Mg2+浓度1.6mmol/L,dNTPs浓度0.3mmol/L,引物浓度0.2μmol/L,Taq DNA聚合酶用量1.6U,扩增产物在100～2000bp之间,扩增条带明亮清晰,反应体系具有良好的稳定性和可重复性。24份试材的测序片段的大小为1090～1091bp,一致性达到99.84%,存在单碱基的缺失与替换,BLAST结果显示,该序列的编码蛋白质与核糖体蛋白S3的N端同源性高;利用单碱基变异可以区分其中的12个甜橙变异株系和＇安江香柚＇,其他变异株系还需要结合其他的分子标记技术来进行鉴别,有待进一步研究。