编号 zgly0000513523
文献类型 期刊论文
文献题名 狐貉源犬瘟热病毒核蛋白基因的克隆及序列比较分析
作者单位 东北林业大学
母体文献 东北林业大学学报
年卷期 2007,35(9)
页码 61-63
年份 2007
分类号 S858.92
关键词 犬瘟热病毒 核蛋白基因 序列分析
文摘内容 参照已发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白基因(N)序列设计合成了1对引物,用RT—PCR方法对从发病狐、貉中分离的MS01、SC01、ZD01三株CDV的N基因进行扩增,并分别将其PCR产物进行克隆和测序。测序结果表明:3病毒分离株N基因阅读框架全长均为1572bp,编码523个氨基酸。利用DNAstar的MegAlign生物软件,将3病毒分离株与Genbank数据库中现有的CDV毒株的N基因序列及推导出的氨基酸序列进行了同源性比较和系统进化树分析,结果发现:3病毒分离株与强毒参考株A75/17等野毒株高度同源,核苷酸同源为96.2%~99.1%,氨基酸同源为96.0%~99.8%,而与疫苗株Onderstepoor相对较远,核苷酸同源为93.6%~94.0%。N基因的系统进化关系分析显示:3病毒分离株均归为强毒株,并且与中国新疆的TN株、中国台湾的Kaohsitmg株基因型最近,表现出一定的地理位置相关性。