植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

编号 zgly0000560636

文献类型 期刊论文

文献题名 植物查尔酮异构酶的生物信息学分析

作者 雷桅  邹祥  向阳  汤绍虎  孙敏 

作者单位 西南大学生命科学学院·三峡库区生态环境教育部重点实验室  西南大学药学院 

母体文献 北方园艺 

年卷期 2008,(2)

页码 193-197

年份 2008 

分类号 Q946.5  Q558 

关键词 查尔酮异构酶  生物信息学  黄酮类化合物 

文摘内容 采用生物信息学方法和工具对GenBank中的洋葱、豌豆、番茄和茶等植物的黄酮类化合物舍成关键酶查尔酮异构酶(CHI)的核酸和氨基酸序列进行了比对、分析和建模，进而对其分子结构、理化性质、亚细胞定位、蛋白转运肽、跨膜结构域、疏水性、分子系统进化、蛋白质二级和三级结构等重要参数进行了预测和推理。结果表明：该类酶基因的全长包括5’、3’非翻译区和一个开放阅读框，无蛋白转运肽，且定位于细胞质基质，是一个疏水性蛋白，二级结构均以随机卷曲和旷螺旋为主要构件，洋葱和豌豆的CHI三维建模成功。