北柴胡鲨烯合酶基因及其编码区cDNA克隆与序列分析

编号 zgly0001380045

文献类型 期刊论文

文献题名 北柴胡鲨烯合酶基因及其编码区cDNA克隆与序列分析

作者 隋春  魏建和  战晴晴  杨成民 

作者单位 中国医学科学院  北京协和医学院药用植物研究所  东北林业大学生命科学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2010年02期

年份 2010 

分类号 S567.79 

关键词 北柴胡  柴胡皂苷  鲨烯合酶基因(SS)  RT-PCR  PCR 

文摘内容 鲨烯合酶(EC.2.5.1.21,squalene synthase,SS)是植物甾醇和三萜化合物生物合成途径中的关键酶。为研究鲨烯合酶在柴胡皂苷生物合成中的作用,以北柴胡(Bupleurum chinense DC.)不定根为试材,采用Trizol法提取总RNA,利用RT-PCR方法从北柴胡中扩增出了鲨烯合酶cDNA特异片段,并进行了克隆、测序。测序结果显示得到了两个序列不同的cDNA(BcSS1和BcSS2),分别为1245bp和1248bp,分别编码414及415个氨基酸。BcSS1和BcSS2间的核苷酸和氨基酸一致性分别为98%和96%。NCBI Blastx结果显示与三岛柴胡和三七SS氨基酸序列相似性最高,BcSS1的一致性分别为99%和90%,BcSS2的分别为97%和87%。在此基础上,利用PCR技术从北柴胡不定根中扩增得到了一个SS基因克隆,长5880bp,包含12个内含子。