枳壳EST-SSR标记的开发

编号 zgly0000662178

文献类型 期刊论文

文献题名 枳壳EST-SSR标记的开发

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 杨春霞  温强  叶金山  朱培林 

作者单位 江西省林业科学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2011,9(1)

页码 123-127

年份 2011 

分类号 S513 

关键词 枳壳  表达序列标签(EST)  简单重复序列(SSR) 

文摘内容 GenBank上已公布的枳壳EST序列为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源。本研究利用在线SSR鉴定软件SSRIT分析来自枳壳EST数据库的11029条Unigene序列。分析结果共发现327条EST序列含有348个SSR位点,占总数的2.96%。其中,三核苷酸重复的SSR类型最多,共有161个,占检索总数的46.26%。Primer 3.0设计合成58对EST-SSR引物,其中36对能扩增出产物,6对引物产生多态性分离,分别占所设计引物总数的62.07%和10.34%。本文研究成果为今后枳壳遗传多样性分析、遗传图谱构建及比较基因组等研究方面奠定了基础。