沙柳SpsLAZY1a和SpsLAZY1b基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001535935

文献类型 期刊论文

文献题名 沙柳SpsLAZY1a和SpsLAZY1b基因克隆及生物信息学分析

作者 张磊  叶志玮  赵晨曦  张国盛  杨海峰 

作者单位 内蒙古农业大学林学院 

母体文献 西北林学院学报 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S793.9 

关键词 沙柳  分枝角度  LAZY1  基因克隆 

文摘内容 LAZY1基因对于植物分枝角度、分枝方向具有重要影响。以沙柳为试验材料克隆LAZY1基因,利用生物信息学软件分析LAZY1基因序列、构建进化树,并预测蛋白结构。结果表明,SpsLAZY1a和SpsLAZY1b的CDS全长分别为1 161、1 143bp,分别编码386和380个氨基酸。生物信息学分析表明SpsLAZY1a、SpsLAZY1b2种蛋白均为亲水性蛋白,均无信号肽区域。氨基酸序列具有IGT基因家族典型结构域,并且其C端有LAZY1蛋白的典型EAR结构。系统发育树将18个LAZY1蛋白家族聚为2个大类,SpsLAZY1a和SpsLAZY1b属于其中第1类,均为双子叶植物,并与其他植物具有较高相似性。氨基酸同源结构比对发现这些植物间既有相似同源区域,也存在一定差异区域。单子叶比双子叶植物缺少某些同源区域,草本比木本植物又缺少某些同源区域。LAZY1基因在沙柳进化过程中发生基因重复,本研究由沙柳中成功克隆SpsLAZY1a、SpsLAZY1b基因,隶属IGT基因家族,并初步揭示LAZY基因的系统进化关系。