红松转录组SSR分析及EST-SSR标记开发

编号 zgly0000955597

文献类型 期刊论文

文献题名 红松转录组SSR分析及EST-SSR标记开发

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张振  张含国  莫迟  张磊 

作者单位 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室  中国林业科学研究院亚热带林业研究所 

母体文献 林业科学 

年卷期 2015(8)

页码 114-120

年份 2015 

关键词 红松  转录组  EST-SSR  遗传多样性 

文摘内容 【目的】红松已开发的分子标记缺乏共显性的遗传标记,尚不能满足分子标记辅助育种的需要。利用转录组数据开发SSR标记目前仍然是较为经济高效的DNA分子标记开发策略,本研究利用高通量测序技术开发红松EST-SSR标记,掌握其在转录组序列中的分布类型及特征,为红松的SSR多样性分析及变异分析提供基础。【方法】利用SSR检索程序从红松转录组41 476条Unigenes中筛选得到1 757个SSR位点,并对SSR位点的数量、分布特征进行统计分析。设计合成101对SSR引物,采用琼脂糖电泳初步检查和聚丙烯酰胺凝胶电泳分离检测方法确定引物的多态性,并收集扩增产物,送测序验证,最终开发出16对SSR引物。