马铃薯转录组EST-SSR挖掘及其多样性分析

编号 zgly0000927243

文献类型 期刊论文

文献题名 马铃薯转录组EST-SSR挖掘及其多样性分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 巩檑  程永芳  甘晓燕  陈虞超  聂峰杰  张丽  石磊  宋玉霞  郭志乾  王峰 

作者单位 宁夏农林科学院农业生物技术研究中心宁夏农业生物技术重点实验室  宁夏大学生命科学学院  宁夏农林科学院固原分院  宁夏农林科学院荒漠化治理研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015(7)

页码 1535-1544

年份 2015 

关键词 马铃薯  转录组  EST-SSR  遗传多样性 

文摘内容 本研究以宁薯4号叶、根和匍匐茎茎尖为材料构建链特异性文库进行转录组测序并对测序数据重新拼接。应用SSR检索软件从74.8 Mb测序数据中(51 006 Unigenes)发掘到1 867个SSR位点,平均发生频率为1/41 kb。