基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部沿海凤鲚种群遗传结构

编号 zgly0001630807

文献类型 期刊论文

文献题名 基于线粒体控制区的序列变异分析中国东南部沿海凤鲚种群遗传结构

作者 阎雪岚  唐文乔  杨金权 

作者单位 上海海洋大学鱼类研究室 

母体文献 生物多样性 

年卷期 2009年02期

年份 2009 

分类号 S917.4 

关键词 Coiliamystus  东南沿海  线粒体控制区  遗传多样性  单系群 

文摘内容 为了解中国东南部沿海凤鲚(Coilia mystus)的种群遗传多样性和遗传结构,本文分析了长江口(CJ)、钱塘江口(QT)、闽江口(MJ)和九龙江口(JL)4个凤鲚地理群体的mtDNA控制区561bp片段的序列变异。65尾样本共检测到28个单元型。4个群体总的单元型多样性和核苷酸多样性均较高(h=0.9433±0.0168,π=0.0317±0.0158),但单个群体的核苷酸多样性水平却很低,其中以CJ最高(π=0.0080±0.0046),MJ最低(π=0.0015±0.0013)。MJ与JL群体之间以及CJ与QT群体之间的平均K2P遗传距离很小,分别为0.3%和0.8%;而CJ、QT分别与MJ、JL群体之间的遗传距离均较大,达到了6%。采用最大似然法(ML)、最大简约法(MP)和邻接法(NJ)分别构建的单元型间的系统发育树揭示,4个凤鲚群体构成CJ-QT和MJ-JL2个支系,且具有极高的支持率。单元型的网络分析也显示这两个支系间有高达28步的突变次数。AMOVA分析显示大部分的遗传变异来自这两支系群体间(90.77%),表明凤鲚群体间存在着显著的地理分化。种群分化指数和基因流分析也表明,支系间群体有着明显的遗传分化(FST>0.9,Nm<0.03)。所有分析结果支持所研究的凤鲚标本属于两个不同的地理种群,且种群的分化至少已达到亚种水平。采用BEAST和TRACER软件得到凤鲚两个亚种的最近共同祖先约在0.34-0.46百万年前,处于更新世晚期,推测可能是第四纪晚期的气候旋回和海平面的升降导致了凤鲚的种群分化。