草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂

编号 zgly0001723120

文献类型 期刊论文

文献题名 草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂

作者 万佳宁  尚俊军  汪滢  李正鹏  王莹  唐利华  茅文俊  汪虹  鲍大鹏  龚明 

作者单位 上海市农业科学院食用菌研究所农业农村部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S646.13 

关键词 草菇  泛素结合酶E2  虚拟筛选  抗冻保鲜 

文摘内容 草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme, UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果表明:在2轮虚拟筛选方法得到500个靶中化合物的基础上,综合考虑可与UBEV2上的Thr73、Gly77、Ile78、Phe84、Gly85、Asp86、Tyr87、Asp79形成多个氢键,以及Ile78、Leu83、Phe84、Asp86、His138、Ile141等形成较强的疏水作用,最终人工挑选得到150个小分子化合物,对接打分值区间为6.58～8.06。抗冻实验结果提示筛选的化合物能够减轻低温对草菇的伤害。