象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测

编号 zgly0001516509

文献类型 期刊论文

文献题名 象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测

作者 陈卫卫  唐然  吴昱煜  李菲  张向前  解新明 

作者单位 华南农业大学林学与风景园林学院  广东省草业工程技术研究中心 

母体文献 草地学报 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 S543.9  Q943.2 

关键词 象草  木质素  苯丙氨酸解氨酶  生物信息学 

文摘内容 苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物木质素生物合成途径中的关键酶,参与木质素、类黄酮和花青素等次生代谢产物的形成。本研究以‘N51’象草(Pennisetum purpureum)为材料,通过同源克隆、3′RACE和hi-Tail PCR的方法,对PAL基因进行克隆,得到PpPALcDNA序列2429bp以及DNA序列全长3907bp。PpPAL编码的蛋白包含720个氨基酸,具有典型的GTITASGDLVPLSYIAG苯丙氨酸解氨酶保守活性基序。运用生物信息学进行分析,PpPAL基因cDNA序列与玉米(Zea mays L.)ZmPAL的相似性最高为94%,与其他禾本科植物也有着较高的相似性。在氨基酸序列系统进化分析中,PpPAL与ZmPAL遗传距离最近,并与其他禾本科植物PAL聚为一类。PpPAL蛋白的三维结构模型显示,PpPAL蛋白具有典型的海马状结构,表明PpPAL是典型的苯丙氨酸解氨酶家族,对木质素的合成起着重要的作用。