甜橙bHLH转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

编号 zgly0001712495

文献类型 期刊论文

文献题名 甜橙bHLH转录因子家族的鉴定及生物信息学分析

作者 孟富宣  杨玉皎  段元杰  吕陟远  陆晓英  郭淑萍  刘海刚 

作者单位 云南省农业科研学院热区生态农业研究所/元谋干热河谷植物园 

母体文献 西南林业大学学报(自然科学 

年卷期 2020年05期

年份 2020 

分类号 S666.4 

关键词 甜橙  bHLH  全基因组  转录因子  鉴定  生物信息学 

文摘内容 bHLH转录因子家族是第2大转录因子家族,广泛存在于微生物、植物以及动物中。以甜橙为试验材料,通过全基因组数据库搜索鉴定,对b HLH基因进行了理化性质、系统发育、染色体分布、保守基序、蛋白互作生物信息学分析,探讨它们在不同组织的表达情况。结果表明:共鉴定出126个bHLH基因,其中112个不均匀的分布于9条染色体上,14个分布位置尚未确定;系统发育分析表明甜橙bHLH基因家族可分为16个亚家族,并且给定亚家族中的大多数基因具有相似的基因结构和保守基序。在甜橙中,多个bHLH基因相互作用共同调控其开花、光的形态发生和花色素苷合成等过程;大多数的CsbHLH基因在愈伤组织、叶、花和果实中均有表达。本研究为CsbHLH基因的功能研究奠定了基础,并有助于bHLH基因在其他植物物种中的功能研究。