白桦EST-SSR信息分析与标记的开发

编号 zgly0000554503

文献类型 期刊论文

文献题名 白桦EST-SSR信息分析与标记的开发

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王艳敏  魏志刚  杨传平 

作者单位 东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2008,44(2)

页码 78-84

年份 2008 

分类号 S718.46 

关键词 欧洲白桦  白桦  EST  SSR  标记 

文摘内容 对NCBI(美国国立生物技术信息中心)中2548条欧洲白桦ESTs的序列进行分析，结果表明：其中260条ESTs中含有306个SSRs，为全部ESTs序列的10.2%，SSR频率为12.01%。其中，二核苷酸重复比例为81.37%，三核苷酸重复比例为16.67%，四核苷酸重复比例为1.96%。不同软件设计引物的效率不同，Primer3设计出176对SSR引物，在白桦中扩增成功的引物比例为59.09%，而具有多态性的引物比例仅为25.96%；SSR Primer设计出100对引物，在白桦中扩增成功的引物比例为37%，而具有多态性的引物比例为48.65%。