毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达

编号 zgly0001548947

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达

作者 程占超  侯丹  马艳军  高健 

作者单位 国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 S795.7 

关键词 林木育种学  毛竹  生长素应答因子  花发育 

文摘内容 生长素反应因子(ARF)基因家族在植物的生长发育中起至关重要的作用。关于毛竹Phyllostachys edulis ARF基因家族在花器官中生物信息学分析未见报道。以毛竹花器官为材料,采用生物信息学的方法,对毛竹中ARF基因进行筛选,并对其系统进化关系、保守基序及在花器官中的差异表达模式进行了初步的分析。结果表明:毛竹全基因组中含有44个ARF基因,分为Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ类。与拟南芥Arabidopsis thaliana和水稻Oryza sativa分别比较,发现毛竹与水稻存在11个姐妹同源基因对。此外,Phe ARF13,Phe ARF14和Phe ARF35在花芽、雌蕊和幼胚中高量表达,同时Phe ARF2,Phe ARF30,Phe ARF14,Phe ARF13,Phe ARF35,Phe ARF7,Phe ARF37,Phe ARF38在雌蕊和幼胚中高量表达,推测这些基因可能在花发育和种子发育中发挥重要的作用。