丹参咖啡酸-O-甲基转移酶基因(SmCOMT1)的克隆及其分析

编号 zgly0001435204

文献类型 期刊论文

文献题名 丹参咖啡酸-O-甲基转移酶基因(SmCOMT1)的克隆及其分析

作者 宋银  王东浩  吴锦斌  周露  王国栋  王喆之 

作者单位 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室  西北濒危药材资源开发国家工程实验室  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S567.53 

关键词 丹参  咖啡酸-O-甲基转移酶  基因克隆  qRT-PCR 

文摘内容 依据丹参转录组数据库得到的咖啡酸-O-甲基转移酶基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR方法从丹参分离得到一个新的COMT基因,命名为SmCOMT1(GenBank注册号为JF693491)。该基因cDNA全长1 158 bp,包含一个长为1 095 bp的开放阅读框,编码364个氨基酸。SmCOMT1 gDNA序列长2 275 bp,包含4个外显子和3个内含子。序列分析结果表明,SmCOMT1编码的多肽具有COMT的序列保守元件,与同科植物罗勒COMT编码的多肽高度同源,同源性达到89%。系统进化树分析表明,SmCOMT1与双子叶植物的COMT亲缘关系较近。qRT-PCR结果表明,SmCOMT1基因在丹参不同组织器官中差异表达,其中茎中的表达量最高,并且其表达受茉莉酸甲酯和病原菌的诱导,显示SmCOMT1基因可能在植物防御反应中发挥作用。