一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NP和P蛋白基因分子特征和遗传进化分析

编号 zgly0001400815

文献类型 期刊论文

文献题名 一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NP和P蛋白基因分子特征和遗传进化分析

作者 陈云霞  刘华雷  郑东霞  赵云玲  黄伟坚  王志亮 

作者单位 中国动物卫生与流行病学中心  广西大学动物科学学院 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2011年03期

年份 2011 

分类号 S852.659.5 

关键词 新城疫病毒  Ⅰ类  NP基因  P基因 

文摘内容 本研究对2009年实验室保存的一株Class Ⅰ新城疫病毒分离株NDV09-056的NP和P基因进行了扩增和序列分析,对其分子特征和遗传进化关系进行了分析。结果表明该分离株NP蛋白基因全长为1746nt,共编码489aa,其N端1～401氨基酸相对比较保守,C端402～479氨基酸变化比较大;同源性分析表明本分离株的NP蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为93.5%～98.5%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于77.0%～79.2%。P蛋白主要氨基酸突变区集中在57～107aa和135～212aa两个区域,而N端和C端相对保守;同源性分析表明本分离株的P蛋白基因与Ⅰ类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为90.4%～95.3%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于68.3%～72.5%。遗传进化分析表明本分离株与Ⅰ类基因3型新城疫病毒代表株NDV08-004的亲缘关系最近。