膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析

编号 zgly0000925404

文献类型 期刊论文

文献题名 膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析

学科分类 220.20;森林培育学

作者 邓楠  史胜青  常二梅  刘建锋  兰倩  江泽平 

作者单位 中国林业科学研究院林业研究所 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2015(2)

页码 28-32

年份 2015 

关键词 膜果麻黄  转录组  芪类  高通量测序 

文摘内容 以不同萌发期间的膜果麻黄(E.przewalskii)种子为研究对象,应用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi SeqTM2000对其进行转录组测序和数据重新组装,结果获得了12 999 122条初始序列,总长为1 169 920 980bp,初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp;与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了49 449个GO功能注释、17 751个COG功能注释以及16 748个KEGG注释;并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。