梅EST-SSR标记的开发及利用

编号 zgly0000658454

文献类型 期刊论文

文献题名 梅EST-SSR标记的开发及利用

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 上官凌飞  李晓颖  宋长年  王西成  王玉柱  章镇  房经贵 

作者单位 南京农业大学园艺学院  北京市农林科学院林业果树研究所 

母体文献 西北植物学报 

年卷期 2010(9)

页码 1766-1772

年份 2010 

分类号 Q789 

关键词 梅  杏  EST-SSR  遗传差异分析 

文摘内容 利用MISA软件对10 123条梅EST序列进行SSR位点查找,得到含SSR位点的序列935条,SSR位点1 233个,平均每100条EST序列中含有12.18个SSR位点。2核苷酸、3核苷酸重复是最主要的重复类型,分别占35.52%和41.36%。设计了40对EST-SSR引物并进行扩增,有24对引物能扩增出理想的PCR产物,其中17对引物具有较好的扩增多态性。测序后发现13对引物中有73.08%的片段具有相应的SSR位点,对杏DNA指纹中部分谱带的测序结果也证明了是梅扩增出的相应的SSR位点。根据本研究含有SSR位点的测序结果推算,从梅EST中开发真实SSR位点的数目为901。随机选择13对引物对杏和梅进行DNA指纹构建与遗传多样性分析,结果发现,来源于梅的EST-SSR引物在杏中有很高的通用性,这些引物把梅和杏分成了两大群体,说明他们是遗传差异明显的两种植物。