赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6基因克隆及序列特征分析

编号 zgly0000701642

文献类型 期刊论文

文献题名 赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6基因克隆及序列特征分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 沈莹  左成学  吴敏  王星果  张营  徐建荣  顾志良 

作者单位 常熟理工学院生物系 

母体文献 安徽农业科学 

年卷期 2010(1)

页码 85-87

年份 2010 

分类号 Q951.3 

关键词 赤眼鳟  ND6基因  DNA序列  系统进化 

文摘内容 [目的]根据赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6(ND6)基因序列分析不同种鱼类的分子进化关系。[方法]根据其他鱼类的线粒体ND6基因及侧翼序列设计引物, 采用PCR扩增并克隆、测序赤眼鳟ND6基因, 通过MEGA4.0Neighbor—Joining法分析不同鱼类的进化关系。[结果]赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体基因组ND6基因序列长度为522bp, 编码173个氨基酸。该基因碱基组成为: A41.5%、C32.7%、G12.4%、T13.4%, 其中A+T含量(54.9%)高于G+C含量(45.1%)。将赤眼鳟ND6基因序列与GenBank中其他11种鱼类ND6基因序列进行比对发现, 赤眼鳟ND6核酸序列与团头鲂的同源性最高, 为90.8%; 与红点鲑鱼的同源性最低, 为73.0%。赤眼鳟ND6氨基酸序列与其他物种ND6氨基酸进行比对发现, 赤眼鳟与团头鲂同源性最高, 为98.3%; 与大黄鱼的同源性最低, 为75.7%。以ND6氨基酸序列采用NJ法构建12种鱼类的系统发生树基本反映了它们的种间、属间和科间的关系。[结论]首次得到了赤眼鳟线粒体ND6基因序列, 并确定了赤眼鳟与其他11种鱼类的分子进化关系。