珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化

编号 zgly0000453203

文献类型 期刊论文

文献题名 珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化

作者 刘军  孙宗修  陈益泰  何贵平  吴天林 

作者单位 中国林业科学院亚热带林业研究所  中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室 

母体文献 中国生物工程杂志 

年卷期 2006,26(12)

页码 50-55

年份 2006 

分类号 Q819 

关键词 毛红椿  微卫星  链亲和素磁珠  SSR反应体系 

文摘内容 以江西宜丰种源毛红椿为材料, 成功提取其基因组DNA。利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片段, 并构建了富含微卫星的基因组文库。从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序, 其中50个单克隆成功测序, 含有微卫星的单克隆有18个, 并根据测序结果设计并合成SSR引物18对。利用所合成的引物优化SSR反应体系, 对影响SSR反应的各个因子进行了探讨。确定了模板DNA最适浓度为30ng; dNTP的最适浓度为0.3mmol/L; 0.3μmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度。建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系, 为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持。