通过HRM技术筛查与梨矮生性状决定位点PcDw紧密连锁的SNP标记

编号 zgly0001493722

文献类型 期刊论文

文献题名 通过HRM技术筛查与梨矮生性状决定位点PcDw紧密连锁的SNP标记

作者 李炜  田义轲  王彩虹  白牡丹  侯董亮 

作者单位 青岛农业大学园艺学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年02期

年份 2015 

分类号 S661.2 

关键词 梨  矮生  性状决定位点PcDw  SNP标记  HRM 

文摘内容 在果树的基因组中存在大量的SNP(single nucleotide polymorphism)位点,筛查与目标性状紧密连锁的SNP标记,对目标基因的精细定位具有重要意义。以‘矮生梨’(Pyrus communis L.‘Aishengli’)与‘茌梨’(Pyrus bretschneideri Rehd.‘Chili’)的F1杂交分离群体共215个单株为试材,参考苹果基因组的序列设计26对适合HRM分析的引物,依据分离群体分组分析(bulked segregant analysis,BSA)原理,通过高通量熔解曲线(high resolution melting,HRM)分析,筛选到两个与决定梨矮生性状的Pc Dw基因连锁的标记CNqau012和CNqau039,二者与目标位点的连锁距离分别是13.3 c M和2.3 c M。对CNqau012和CNqau039的扩增子测序分析表明,在矮生型与普通型中都存在一处单核苷酸变化(分别是G/A和C/T)。这些标记的获得对Pc Dw基因的精细定位及克隆具有重要意义。