应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异

编号 zgly0001422213

文献类型 期刊论文

文献题名 应用基因表达系列分析(SAGE)技术研究高温处理前后家蚕的基因表达差异

作者 鲍忠赞  张彩霞  徐世清  周前凯  魏广兵  王华  刘腾  金鑫  司马杨虎 

作者单位 苏州大学基础医学与生物科学学院 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S881.2 

关键词 家蚕  高温  基因表达系列分析技术  差异表达基因 

文摘内容 高温对家蚕的生理和免疫能力有明显影响。为从分子水平上探究家蚕抗高温机制,应用基因表达系列分析(SAGE)技术获得家蚕5龄雌蚕高温处理前后中肠、丝腺和脂肪体组织的基因表达谱,构建高温组(34℃)和常温组(26℃)2个家蚕SAGE文库。2个家蚕SAGE文库分别包含3555107和3580976个原始标签,其中的标签种类分别为113684和131 296个,清洁标签的种类分别为45972和49467。比较2个文库清洁标签获得65 535种差异标签,共注释4249个基因,其中有1 062个差异表达的基因(P<0.05,错误检测率FDR≤0.001并且拷贝数的差异在2倍以上)。经GO分析发现2个文库中基因的分布极其相似,表明这些基因在不同的环境温度下有类似的生物学功能并参与类似的生理代谢过程。KEGG pathway分析显示有732个基因涉及176个KEGG路径,其中有40个为差异表达基因显著富集的路径(P<0.05),超过一半的路径与代谢、生物合成和信号传导有关。上述结果有助于对家蚕抗高温基因的鉴定以及探究基因调控的网络关系。