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家蚕正反交组合F1代的基因表达系列分析(SAGE)文库构建



编号 zgly0001422195

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕正反交组合F1代的基因表达系列分析(SAGE)文库构建

作者 张彩霞  鲍忠赞  徐世清  周前凯  魏广兵  王华  刘腾  金鑫  司马杨虎 

作者单位 苏州大学基础医学与生物科学学院 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2012年02期

年份 2012 

分类号 S881.2 

关键词 家蚕  基因表达系列分析文库  正反交  差异表达基因  功能 

文摘内容 家蚕杂交组合存在普遍的正反交遗传表型差异现象,为探讨引起正反交组合遗传差异的分子机制,构建家蚕品种75新×7532正交F1代雌雄个体和7532×75新反交F1代雌雄个体共4个基因表达系列分析(SAGE)文库。通过正反交组合同性别子代样本间的比较,显示低表达的标签在种类上占大多数,而高表达的标签在数量上占绝对优势。以错误检测率(FDR)≤0.001且拷贝数倍数差异在2倍以上作为比较样本筛选差异表达基因(DEGs)的条件,在7532×75新的雄性样本里面有298个上调基因和46个下调基因,而在雌性样本里有453个上调基因和240个下调基因。进一步对差异表达基因进行GO和KEGG路径功能分析,筛选出在显著性富集路径中的差异表达基因,其中参与新陈代谢途径、氧化磷酸化途径以及信号传导途径的差异基因在反交组合的子代中表达明显上调。

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