毛果杨HDAC基因家族序列及其表达分析

编号 zgly0000980607

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨HDAC基因家族序列及其表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李淑娟  张超  张彦妮  董亚茹  马旭俊 

作者单位 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)  东北林业大学园林学院 

母体文献 西北农林科技大学学报;自然科学版 

年卷期 2015(3)

页码 63-76

年份 2015 

关键词 毛果杨  组蛋白去乙酰化酶  生物信息学  脱落酸(ABA)  基因表达 

文摘内容 【目的】研究毛果杨组蛋白去乙酰化酶(HDAC)基因家族序列及其对脱落酸(ABA)的应答反应,为HDAC家族基因的功能研究奠定基础。【方法】采用生物信息学方法对毛果杨HDAC家族的16种蛋白进行系统分析;采用实时荧光定量PCR方法,分析了100μmol/L ABA叶面喷洒处理后6和24h毛果杨叶片HDAC家族16个基因的表达情况。【结果】HDAC家族蛋白分析显示,毛果杨HDAC可分为3个亚家族,即RPD3/HDA1、HD2和SIR2亚家族,与拟南芥HDAC蛋白的亲缘关系较近。HDAC家族大多数成员为亲水性蛋白质(HDA912属于疏水性蛋白),其等电点呈酸性(除了HDA912和SIR2亚家族)。