应用计算机进行BT-ICP基因的分类和同源性比较

编号 zgly0001153122

文献类型 期刊论文

文献题名 应用计算机进行BT-ICP基因的分类和同源性比较

作者 余健秀  庞义  龙綮新  庄美宝  邓日强 

作者单位 中山大学昆虫学研究所!生物防治国家重点实验室  广州510275  中山大学昆虫学研究所!生物防治国家重 

母体文献 昆虫天敌 

年卷期 1995年03期

年份 1995 

分类号 S476.1 

关键词 苏云金杆菌  杀虫晶体蛋白基因  同源性  基因分类  目标生物 

文摘内容 本文应用DNASIS(V7.12)和PROSIS(V7.12)软件、GenBank(1994.8,Releasee 84.0)和Swiss—Prot(1994.2,Releasee 28.0)数据库对苏云金杆菌(Bacillus Thuringiensis,BT)杀虫晶体蛋白(Insecticidal Crystal Proteins,ICPs)及其编码基因进行了检索,在此基础上对ICPs基因序列结构的同源性、DNA片段总碱基数、晶体蛋白氨基酸数及分子量、晶体蛋白基因编码序列(CodingSequence,CDS)范围、目标生物等进行了比较,发现属同一基因型的不同菌株来源的晶体蛋白基因编码蛋白区的序列几乎完全一样,同源性高达99％,而不同基因型编码的蛋白氨基酸序列则差异较大。文中根据上述资料对100个苏云金杆菌晶体蛋白基因进行归类,将之分为cryⅠ——cryⅧ、cytA、cytB等10类36个亚类,还对晶体蛋白基因分类的有关问题进行了讨论。