白三叶质子焦磷酸酶基因TrVP1生物信息学分析及定量表达

编号 zgly0001644855

文献类型 期刊论文

文献题名 白三叶质子焦磷酸酶基因TrVP1生物信息学分析及定量表达

作者 雍斌  覃晓李  张艳  吴星  李州  贾彤  彭燕 

作者单位 四川农业大学动物科技学院草业科学系 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年15期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S541.2 

关键词 白三叶  氢离子焦磷酸化酶  基因克隆  信息学分析  定量表达 

文摘内容 质子焦磷酸酶（H+-PPase）在提高植物抗逆性方面发挥着重要的作用。本试验以白三叶品种‘拉丁诺’（Trifolium repens cv.‘Ladino’）c DNA为模板克隆出了白三叶H+-PPase基因TrVP1的全长序列,并利用相关分析软件和网站对其进行生物信息学分析,并研究它在非生物胁迫及信号物质诱导下的表达模式。结果表明,TrVP1全长为2 594 bp,开放阅读框（ORF）为2 304 bp,共编码767个氨基酸;其编码蛋白为亲水性跨膜蛋白,分子量80.49 k D,等电点p I 5.18,多序列比对及系统进化树分析显示该基因属于Ⅰ型VP家族。采用荧光定量（qRT-PCR）方法分析TrVP1的表达模式发现,重金属（CdSO4）、低温（4℃）、高温（35℃）、干旱（PEG-6000）和盐（NaCl）胁迫均显著上调了白三叶根系中TrVP1的表达量,但下调了叶片中TrVP1的表达量。此外,白三叶根系中TrVP1的表达受到Ca2+信号的显著诱导,而叶片中的TrVP1表达则受到抑制。与此同时,NO和H2O2信号对白三叶根系和叶片中TrVP1的表达均起到抑制作用。本试验为深入研究质子焦磷酸化酶基因,提高白三叶抗逆性的功能及其应用提供了理论依据。