伞裙追寄蝇滞育关联基因的转录组学分析

编号 zgly0001720229

文献类型 期刊论文

文献题名 伞裙追寄蝇滞育关联基因的转录组学分析

作者 张博  韩海斌  徐林波  高书晶  甘霖  岳方正  刘爱萍 

作者单位 中国农业科学院草原研究所  阿拉善盟科技信息研究所  国家林业和草原局森林和草原病虫害防治总站 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2020年08期

年份 2020 

分类号 S476.3 

关键词 伞裙追寄蝇  转录组测序  滞育  滞育关联基因  KEGG分析 

文摘内容 【目的】本研究旨在探讨调控伞裙追寄蝇Exorista civilis滞育的重要关联基因以及代谢途径,为明确该虫在转录组水平下的滞育分子机制提供理论基础。【方法】采用新一代高通量测序平台Illumina HiSeqTM2000对伞裙追寄蝇非滞育以及滞育的蛹进行转录组测序分析以及生物信息学分析;应用KAAS在线pathway比对分析工具对筛选出的满足padj<0.05且fold change≥32或padj<0.05且fold change≤1/32条件的差异表达基因进行KEGG通路富集分析。【结果】根据测序结果,共获取58 050个基因。差异倍数在32倍以上的滞育关联基因（diapause-associated genes, DAGs）有454个,其中406个表达上调,共涉及134条通路,包括氧化磷酸化、柠檬酸循环及其他重要通路;48个表达下调,涉及32条通路。KEGG通路富集分析结果表明,滞育关联基因主要集中在信号转导、内分泌系统、碳水化合物代谢等途径中。【结论】本研究获得的伞裙追寄蝇转录组数据揭示了其滞育调控的重要代谢途径与关联基因。