高效检测板栗群体基因频率方法的建立

编号 zgly0001397031

文献类型 期刊论文

文献题名 高效检测板栗群体基因频率方法的建立

作者 艾呈祥  李国田  张力思  苑克俊  孙山  刘庆忠 

作者单位 山东省果树研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2011年01期

年份 2011 

分类号 S664.2 

关键词 板栗群体  SSR  多重PCR  混和样本  基因频率 

文摘内容 以17个板栗群体为试材,采用ABI全自动遗传分析仪,利用5’端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率,建立板栗群体混合样本等位基因及其频率的分析方法。与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高,荧光引物CmTCR10(NED)共检测到78个等位基因,平均每个群体4.6个;引物CmTCR24(6-FAM)检测到41个等位基因,平均每个群体2.4个。多重PCR荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同的等位基因。荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度。用GeneScan获取数据,用Genotyper软件对数据进行设置与输出,使用R软件的FREQS-R模块,初步探讨利用荧光SSR定量化数据,计算供试群体混合样本的等位基因频率,可通过荧光SSR产物的丰度来确定混合取样群体的基因频率。