基于COI基因5’端与3’端序列田间常见粉虱的分子鉴定

编号 zgly0001478102

文献类型 期刊论文

文献题名 基于COI基因5’端与3’端序列田间常见粉虱的分子鉴定

作者 李小凤  田虎  张金良  张桂芬  陈苗苗  万方浩 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所  植物病虫害生物学国家重点实验室  北京市植物保护站  农业部外来入侵生物预防与控制研究中心 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2014年04期

年份 2014 

分类号 S433 

关键词 粉虱  COI基因  系统发育分析  遗传距离  物种鉴定  DNA条形码 

文摘内容 【目的】粉虱种类繁多,个体微小,其种类识别与鉴定常需借助分子生物学技术。本研究旨在明确线粒体COI基因(mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene)5’端和3’端序列对常见种类粉虱识别鉴定的可行性。【方法】以我国田间常见的16种粉虱为对象,以COI基因5’端(641 bp)和3’端(738 bp)序列为靶标进行比对分析,以MEGA 5.10软件的K2-P模型计算种内与种间遗传距离,以邻接法(NJ法)构建进化树并进行系统发育分析。【结果】当以5’端为靶标时,16种粉虱的种内平均遗传距离为0.0015,种间平均遗传距离为0.2897,种间遗传距离为种内遗传距离的193.1倍;而且种内、种间遗传距离没有重叠区域。当以3’端为靶标时种内平均遗传距离为0.0007,种间平均遗传距离为0.2817,种间遗传距离为种内遗传距离的402.4倍;但桑粉虱Pealius mori与烟粉虱Bemisia tabaci Asia II 1的种内和种间遗传距离重叠。系统发育分析结果显示,以5’端为靶标时,16种粉虱可以形成独立的进化分支;以3’端为靶标时,除桑粉虱与传统分类学不一致外,其余种类均可形成独立的分支。【结论】结果表明,5’端序列更适用于基于DNA条形码技术的物种识别鉴定研究。