DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定

编号 zgly0000609412

文献类型 期刊论文

文献题名 DNA条形码识别 Ⅵ：基于微型DNA条形码的果实蝇物种鉴定

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 范京安  顾海丰  陈世界  莫帮辉  温演庆  何万兴  刘伟  曾晓茂 

作者单位 四川出入境检验检疫局  中国科学院成都生物研究所  中国科学院成都计算机应用研究所 

母体文献 应用与环境生物学报 

年卷期 2009,15(2)

页码 215-219

年份 2009 

分类号 S41-33  Q523 

关键词 实蝇科  COI基因  DNA条形码  微型DNA条形码  物种鉴定 

文摘内容 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料，将其DNA条形码（mtDNACOI基因648 bp）与微型DNA条形码（mtDNACOI基因50-200 bp）数据进行比较分析，探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性. 采用虚拟实验（Silico analysis），将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648 bp、160 bp、50 bp三个片段，通过构建NJ树，并进行遗传距离分析，得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100%、94%、84%. 同时做了实体实验（Empirical test），得到了果实蝇属6个物种的COI序列，将其与虚拟实验中的49个样本序列合并，以DNA-barcode指定序列5＇端160 bp序列为分析基础，通过遗传距离分析，得出其鉴定物种的准确性为94%，验证了虚拟实验结果. 即微型DNA条形码（Minimalist-barcode）鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致，均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据. 图2 表1 参29 附1