黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定

编号 zgly0001540189

文献类型 期刊论文

文献题名 黄肉苹果转色期前后类胡萝卜素合成相关差异表达基因鉴定

作者 宋成秀  张利义  张彩霞  田义  丛佩华 

作者单位 中国农业科学院果树研究所农业部园艺作物种质资源利用重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S661.1 

关键词 苹果  黄肉  转录组  类胡萝卜素  MdCCD4 

文摘内容 为了了解黄肉苹果种质成熟时富集类胡萝卜素的分子机制,以黄肉种质‘东北黄海棠’为材料,选择转色期前后(盛花后90 d和115 d)两个发育时期的果实进行RNA-seq测序,分析两个样本差异表达基因,并利用实时荧光定量PCR技术验证获得的类胡萝卜素合成相关差异表达基因的表达水平。结果获得两个样本显著差异表达基因共3 056个,与盛花后90 d果实比较,成熟期果实中有1 270个基因上调表达,1 786个基因下调表达。对这些表达差异基因进行了Pathway富集分析,结果显示差异表达基因涉及类胡萝卜素、苯丙氨酸以及类黄酮等代谢途径,其中类胡萝卜素代谢途径基因有3个上调,4个下调。通过对这7个差异表达基因进一步的qRT-PCR及聚类分析,发现一个新的候选基因MdCCD4b,该基因与菊花以及桃等CCD4聚为一类,与其他作物功能已知的CCD4一样,其表达水平与黄肉种质中类胡萝卜素积累呈负相关,推测黄肉种质果实成熟后类胡萝卜素的富集与MdCCD4b基因显著下调有关。