擎天凤梨花器官全长cDNA文库的构建及EST分析

编号 zgly0001371373

文献类型 期刊论文

文献题名 擎天凤梨花器官全长cDNA文库的构建及EST分析

作者 刘建新  沈福泉  田丹青  张智  葛亚英  沈晓岚  俞信英  王炜勇 

作者单位 浙江省农业科学院花卉研究开发中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2009年06期

年份 2009 

分类号 S682.39 

关键词 擎天凤梨  cDNA文库  SMART  EST  COG 

文摘内容 为了通过基因工程手段来培育花色丰富、花型奇特的擎天凤梨新品种,从擎天凤梨中筛选出花色、花型相关调控基因则是十分必要的。本研究以擎天凤梨属品种Ostara为材料,采用SMART技术成功构建了擎天凤梨花器官的质粒型全长cDNA文库,初始文库滴度为3×106,插入片段平均长度大于1kb;随机挑取2004个阳性克隆进行5’EST测序,获得高质量序列1758条,经拼接获得1365条单基因簇(unigene),其中跨叠群(contig)175个和单条序列(singlet)1195个;经ORF寻找共获得有效ORF1283条;经COG分析EST序列编码的蛋白质被分为22类;经Blast分析后,获得一批花色、花器官发育、花期调控以及其它育种价值基因(包括cDNA全长或片段)。该研究结果为擎天凤梨的花色、花型转基因等育种奠定了基础。