荒漠植物红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库的构建及特性

编号 zgly0001603052

文献类型 期刊论文

文献题名 荒漠植物红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库的构建及特性

作者 殷恒霞  石勇  张雯  燕霞  马小飞 

作者单位 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所甘肃省寒区旱区逆境生理生态实验室  中国科学院大学 

母体文献 中国沙漠 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 Q943.2 

关键词 红砂(Reaumuriasoongarica)  微卫星  磁珠  富集文库 

文摘内容 采用磁珠富集法构建了红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。结果表明:在获得的13 922条微卫星序列中完美型占88%,非完美型10%,混合型2%。微卫星重复基元显示5种类型,以三碱基基元(GGT)n、(TGG)n、(ACC)n最多,占总数的60.7%;其次为二碱基基元,主要是(AC)n、(GT)n、(CA)n,占38.6%;这5种微卫星重复基元的重复次数多集中在5~10。通过对随机挑选的100条微卫星序列设计引物,并以遗传距离和地理距离较远个体的基因组为模板进行扩增筛选,可有效扩增的引物为62对,并进一步测序筛选获得了12对多态性微卫星引物。磁珠富集法是开发红砂基因组微卫星序列的一种高效、可行的方法,构建的微卫星文库效率较高,富集量大,重复基元类型丰富,为红砂遗传进化和种质资源保护提供了可靠的数据支持和高效的分子遗传标记。