核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析

编号 zgly0001476053

文献类型 期刊论文

文献题名 核桃Y2SK2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析

作者 徐丽  陈新  魏海蓉  张力思  宗晓娟  王甲威  朱东姿  刘庆忠 

作者单位 山东省果树研究所  山东省果树生物技术重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2014年08期

年份 2014 

分类号 S664.1 

关键词 核桃  脱水素基因  定量RT-PCR  单核苷酸多态性 

文摘内容 采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regia L.‘Xiangling’)叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank登录号KC503061.1),其全长1 056 bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素。以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4℃处理4 h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能。‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低。单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697。