中国樱桃LTR类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析

编号 zgly0001693171

文献类型 期刊论文

文献题名 中国樱桃LTR类反转录转座子反转录酶序列的克隆和分析

作者 刘厚宇  吴敏芳  文晓鹏 

作者单位 贵州大学农业生物工程研究院/贵州大学生命科学院山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室  贵州大学林学院/贵州省森林资源与环境研究中心  贵州省清镇市农业农村局 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S662.5  Q943.2 

关键词 樱桃  中国樱桃  Ty1-copia  Ty3-gypsy  反转录酶  序列分析  转录活性 

文摘内容 利用同源序列法根据Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶保守区设计简并引物,从中国樱桃(Prunus pseudocerasus Lindl.)中分别扩增出约260和430 bp的目标片段,并进行克隆、测序、序列分析及转录活性检测。共获得44条Ty1-copia类反转录酶序列,13条Ty3-gypsy类反转录酶序列,序列间显示高度异质性,部分序列存在缺失、终止密码子及移码突变。系统发育树显示Ty1-copia可以分为TAR、Ale两类,Ty3-gypsy可以分为Tat、Reina、Tekay等3类。Ty1-copia和Ty3-gypsy类反转录酶dN/dS值均小于1,并且Ty3-gypsy高于Ty1-copia。13条Ty1-copia以及7条Ty3-gypsy反转录酶序列在樱桃正常生长条件下均有转录活性,但不受8种非生物胁迫的诱导。PpRT7在高温(42℃)胁迫24 h时转录活性升高,并且具有组织特异性。