盐胁迫下卷丹百合MAPK基因的克隆和序列分析

编号 zgly0001528997

文献类型 期刊论文

文献题名 盐胁迫下卷丹百合MAPK基因的克隆和序列分析

作者 蔡东  陈丽静  孙少坤  程福星  张丽  李天来 

作者单位 沈阳农业大学辽宁省农业生物技术重点实验室设施园艺省部共建教育部重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年09期

年份 2016 

分类号 S682.29 

关键词 卷丹百合  促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)  盐胁迫  阈值浓度  同源性 

文摘内容 本研究通过卷丹百合在不同浓度的盐胁迫下确定了盐浓度阈值,利用同源克隆和RACE技术获得了盐阈值浓度处理下卷丹百合MAPK基因的保守区(Genbank登录号:JQ437268),并对其进行生物信息学分析。同时利用了DNAman软件和Blastn序列比对在基因和蛋白角度分析了MAPK基因在盐阈值浓度处理下的表达情况。分析表明,卷丹百合盐阈值浓度为1.09 mg/m L,MAPK基因保守区长627 bp,推测编码209个氨基酸,有1个高度保守的区域(TRWYRAPE)存在于MAPK氨基酸序列中,通过NCBI上的BLAST比对分析,发现这段保守区序列为促分裂原活化蛋白激酶超家族的催化活性区。