去除二硫键和蛋白残基对银杏抗菌蛋白构象的影响

编号 zgly0001534056

文献类型 期刊论文

文献题名 去除二硫键和蛋白残基对银杏抗菌蛋白构象的影响

作者 史晓璇  陈洪 

作者单位 中南林业科技大学材料科学与工程学院 

母体文献 中南林业科技大学学报 

年卷期 2016年10期

年份 2016 

分类号 S792.95 

关键词 分子动力学模拟  二硫键  蛋白自身残基  银杏抗菌蛋白  结构稳定 

文摘内容 通过分子动力学模拟,研究了二硫键以及蛋白自身残基在维持蛋白构象稳定中起到的作用,对野生型、截断型和突变型的银杏抗菌蛋白Ginkbilobin-2(Gnk-2)的构象变化进行了分析。结果表明:在100 ns的模拟时间内,造成蛋白构象发生显著变化的主要原因,是蛋白自身残基的缺失,而短时间内二硫键在维持蛋白结构稳定方面的作用并不明显。仅通过比较短时间内模拟所得到的截断型和野生型蛋白的结构变化无法判断二硫键对蛋白结构稳定性的影响。这与文献中仅通过100 ns的时间内模拟野生型和截断型蛋白均方根位移(RMSD)值的变化趋势,便判断出二硫键的断裂是引发蛋白构象发生显著变化的主要原因的看法,是不一致的。这些结果对揭示二硫键以及蛋白自身残基在维持蛋白质空间构象及其生物活性中所起的作用具有重要的意义。并且对银杏抗菌蛋白的深入研究和开发也提供了理论支持。