黄果柑XET基因的克隆及其序列分析

编号 zgly0001528918

文献类型 期刊论文

文献题名 黄果柑XET基因的克隆及其序列分析

作者 古咸杰  曹淑燕  李清南  廖玲  熊博  孙国超  汪志辉 

作者单位 四川农业大学园艺学院  四川农业大学果蔬研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年06期

年份 2016 

分类号 S666 

关键词 黄果柑  XET  克隆  序列分析 

文摘内容 以成熟的黄果柑果实为材料,根据已登录植物的XET基因并参考甜橙基因组设计特异性引物,采用同源克隆方法,获得黄果柑XET基因完整的编码区序列,命名为Cit XET。运用生物学软件对该序列及其编码的氨基酸序列进行相关生物信息学及结构功能分析,结果显示黄果柑XET基因长960 bp,与其它植物序列具有较高的同源性。该基因编码319个氨基酸,蛋白质分子量为37.4547 k D,等电点为9.05,分子式为C1724H2548N*（448）O466S14,是一个具有跨膜结构的亲水性蛋白。序列比对及进化树分析,XET在进化的过程中具有高度的保守性。同时,Cit XET蛋白二级结构有21%的α-螺旋,30.72%的延伸链,9.09%的β-转角,39.18%的无规蜷曲。黄果柑XET具有GH16等结构域,属于糖苷水解酶GH16超家族的成员,其含有该家族的特征基序DEIDFEFLG和β-卷芯（β-jellyroll）折叠结构,同时预测该蛋白质可能参与碳水化合物代谢,木葡聚糖代谢,细胞壁生物合成等过程。本研究分离鉴定了黄果柑XET基因,同时初步了解该基因的生物学信息,有助于进一步探讨其的表达模式和具体功能,为黄果柑果实品质的改善提供理论依据。