桂花EST-SSR引物开发及在品种鉴定中的应用

编号 zgly0001573771

文献类型 期刊论文

文献题名 桂花EST-SSR引物开发及在品种鉴定中的应用

作者 李军  董彬  张超  付建新  胡绍庆  赵宏波 

作者单位 浙江农林大学风景园林与建筑学院  浙江理工大学建筑工程学院 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 S685.13 

关键词 植物学  桂花  EST-SSR  体系优化  引物筛选  品种鉴定 

文摘内容 利用L16(45)正交实验设计,针对模板DNA,镁离子(Mg2+),d NTPs,Taq DNA酶和引物5个因素进行正交优化,建立适用于桂花Osmanthus fragrans表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)的最优扩增反应体系,将其用于桂花转录组EST-SSR多态性引物的筛选,最后利用筛选得到的多态性引物和聚类分析对14份四川省常见的栽培丹桂(SC01~SC14)样本进行品种鉴定。结果表明:桂花EST-SSR最优反应体系包含40 ng模板DNA,2.25 mmol·L-1Mg2+,0.3μmol·L-1引物,0.3 mmol·L-1d NTPs,1.25×16.67 nkat Taq DNA聚合酶,10×PCR Buffer缓冲液2μL,双蒸水补至20μL;从150对EST-SSR引物中筛选得到了19对稳定性好、多态性高的SSR引物,多态性从高到低依次为五核苷酸(25.00%),六核苷酸(19.44%)和三核苷酸(16.67%)重复类型。利用筛选得到的3对高度多态性SSR引物(OF8623-1677,OF24299-844和OF28774-2088)对四川省成都市周边常见栽培的14份丹桂(Aurantiacus group)样本进行了有效鉴定。结果表明:14份样本中,有12份可判定为‘朱砂丹桂’‘Zhusha Dangui’,SC06为‘堰红桂’‘Yanhong Gui’,SC08与‘满条红’‘Mantiao Hong’和‘状元红’‘Zhuangyuan Hong’亲缘关系较近。本研究也为今后利用EST-SSR标记对桂花指纹图谱构建、遗传多样性分析、分子育种及品种鉴定与保护等工作奠定基础。