杨树SABP2基因的克隆与分析

编号 zgly0001569391

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树SABP2基因的克隆与分析

作者 董慧霞  理永霞  贾秀贞  吕全  张星耀 

作者单位 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所国家林业局森林保护学重点实验室  南京林业大学南方现代林业协同创新中心  河南师范大学生命科学学院  中国林业科学研究院林业新技术研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年03期

年份 2017 

分类号 S792.11 

关键词 84K杨  水杨酸结合蛋白2(SABP2)基因  生物信息学 

文摘内容 【目的】克隆84K杨水杨酸结合蛋白2（Salicylic acid-binding protein 2,SABP2）基因并预测其功能。【方法】以生长至5片小叶的84K杨组培苗为材料,提取其叶和茎的总RNA。根据毛果杨SABP2基因（GenBank序列号:XM002310718.2）的完整CDs序列,设计84K杨SABP2基因的引物,采用RT-PCR技术扩增84K杨SABP2基因全长,然后连接到pGM-T克隆载体,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞,对84K杨SABP2基因进行克隆,获得该基因的全长序列。通过各种在线软件对84K杨SABP2基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。【结果】84K杨基因的cDNA序列全长822bp,开放阅读框789bp,编码263个氨基酸。生物信息学分析表明,84K杨SABP2与毛白杨SABP2（GenBank序列号:JQ086570.1）的同源性最高,达98%;84K杨SABP2基因位于微体中;SABP2蛋白有11个蛋白质结合位点,属于α/β折叠水解酶家庭成员中的酯酶,为亲水性蛋白。【结论】成功克隆了84K杨的SABP2基因,其功能与前人对草本植物中SABP2部分功能的研究结果一致。