A型产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因分析及其蛋白结构与抗原表位预测

编号 zgly0001469613

文献类型 期刊论文

文献题名 A型产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因分析及其蛋白结构与抗原表位预测

作者 冶贵生  马玉花  韩志辉  邹勇  贾跃宁 

作者单位 青海大学农牧学院  西北农林科技大学动物医学院 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2014年08期

年份 2014 

分类号 S852.616.3 

关键词 A型产气荚膜梭菌  α毒素  序列分析  表位  蛋白结构 

文摘内容 应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因进行扩增,并进行测序,利用生物软件对α毒素基因序列进行分析,对蛋白结构、B细胞抗原表位进行预测。结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因长度为1 110bp,编码370个氨基酸。与参考菌株T0、S16、NRRLB-23744、KZ211和CER89L1216的α毒素基因核苷酸序列同源性依次为99.9%、99.9%、99.9%、99.9%和99.7%,氨基酸序列同源性均为100%。综合α毒素蛋白亲水性、表面可能性、抗原指数及二级结构预测结果显示在26-29、71-78、111-114、182-185、189-192、264-268、272-275、282-285、294-297、362-365位氨基酸残基存在可能的B细胞抗原表位,结合三级结构预测结果显示,α毒素294位-297位氨基酸残基形成表位并结合抗体的可能性较高。研究结果可为A型产气荚膜梭菌表位疫苗的设计与研制提供基础。