黑莓(Rubus spp.)TT12基因的同源克隆及其生物学信息分析

编号 zgly0000943409

文献类型 期刊论文

文献题名 黑莓(Rubus spp.)TT12基因的同源克隆及其生物学信息分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 冯琛  陈清  汤浩茹 

作者单位 四川农业大学园艺学院 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2015(11)

页码 2473-2482

年份 2015 

关键词 黑莓  TT12(TRANSPARENT TESTA 12)基因  克隆  生物学信息分析 

文摘内容 从长势良好‘阿拉好’黑莓(Rubus spp.)的果实中提取并分离总RNA,反转录成c DNA,根据已登录的黑莓转录组数据,参考其它植物透明外种皮基因(TRANSPARENT TESTA 12,TT12)设计引物,通过RT-PCR扩增得到目的条带,命名为Ru TT12-1。序列分析发现:Ru TT12-1基因全长1 659 bp,具有一个1 464 bp的开放阅读框,编码486个氨基酸,蛋白质分子量为53.09 k D,等电点为5.416。同源性分析表明,其核苷酸序列与其它植物TT12同源基因的一致性为71%~89%。